El servicio de Control de Calidad es un laboratorio que brinda servicios de análisis de medicamentos, cosméticos, productos herbales y naturales, agroquímicos, dispositivos médicos y afines. Realiza análisis Microbiológico, Físico y químico y de Modelos biológico y toxicológico de productos elaborados a nivel nacional e internacional.
Actualmente se encuentra acreditado con la NTP ISO/IEC 17025 por el Instituto Nacional de Calidad (INACAL) en 18 métodos de ensayo; dentro de los cuales están los análisis de alcaloides de la Uña de gato, contenido de vitamina C en pulpa de camu camu y bencilglicosinolato en Harina de Maca. Así como pruebas toxicológicas y microbiológicas para productos de origen botánico entre otros.